En el cas de les actuacions subvencionades dins la línia d'acords de custòdia, normalment l'actuació subvencionada contempla el seu seguiment. Per exemple, el projecte de construcció del connector fluvial de la resclosa de la Pilastra al riu Ter preveu un seguiment de la seva efectivitat i que ja s'està duent a terme per part del Consorci del Ter. A banda d'això, l'ACA també impulsa estudis sobre l'efectivitat dels connectors fluvials, tal com està reflectit a l'apartat corresponent del programa de mesures (Capítol A2). Actualment hi ha uns treballs en marxa per fer el seguiment de l'efectivitat de 5 connectors fluvials. Quan es tinguin resultats es publicaran.