És cert que la contaminació dels nitrats pot tenir diferents orígens. Per això s'inclou una mesura per a la caracterització de zones amb presència de contaminació difosa per nitrats, distribució en l'espai i discriminació de l'origen del nitrogen, tant per aigües superficials com subterrànies i una altra per a avaluar les aportacions de nitrogen no agrari al medi hídric.