En el sentit de la gestió hidrològica, el funcionament del Baix Ter és molt diferent al de l'Alt Ter. Aquesta diferència té implicacions diverses en la gestió, i afectarà de manera diferent en funció de quin tipus de mesures estiguem parlant. D'altra banda, aigües avall de les grans infraestructures fluvials que tenen una alta capacitat de modificar el règim de cabals del riu, s'han definit uns cabals generadors, d'obligat compliment, a fi d'assegurar el bon estat ecològic del rius.